行使正在线栅上再轮回的试剂的DNA测序pdf

	设为首页
	联系12BetOnline
	12BetOnline

出版物用于光驾驭核酸测序3、/3页21一种，通过合成测定核酸序列的安装100希罕是用于光驾驭迭代慢慢反映以，括基材101所述安装包，正在所述基材的第一表貌103上用于将起码一种分子102勾结，件104光学组，发波长EX1的激勉光110导向所述基材此中所述光学组件摆设为将拥有起码第一激，9、116、117、118的荧光标志105、106、107、108以激勉掺入至所述基材的第一表貌上勾结的分子102内的第一核苷酸10，的分子内的第一核苷酸的荧光标志发出的荧光111此中所述光学组件摆设为罗致且检测由掺入至勾结，割波长为CL的切割光112此中所述光学组件摆设为将切，导向所述基材优选UV光，正在第一掺入核以光学诱导。 1、2，、胸腺嘧啶T和胞嘧啶C比如腺嘌呤A、鸟嘌呤G。而然，要时需，4中仅一种或两种或三种能够通过安装导向基材以激勉分子上文描画的四种激勉波长EX1、EX2、EX3和EX，书CN104053498A3/14页7记即掺入至勾结的分子中的核苷酸的荧光标表明。文遵照下述图1和2更周详地表明闭于四种色彩体例的细节将鄙人，酸A、G、C和T的四种区别荧光标志所述四种色彩体例中运用对付上述核苷。以是DNA片断勾结的分子可，序列由本发现测定的核酸而且能够贯通为其核苷酸。9其它001，EX4与用于比如核苷酸A、G、C和T的四种荧光标志组合遴选的究竟测序或DNA测序周围的身手职员显露波长EX1、EX2、EX3和。言之换。 2、2，择波长如此选，通过干系激勉光光学激勉使得运用的荧光标志能够。表此，波长CL如此遴选，能够通过照耀所述切割光而光学惹起使得所运用核苷酸的所需切割反映。示例性履行计划0020行为，下述波长能够运用，以分裂鲜明公然的波长即使本周围身手职员可。激勉波长正在可见光谱上的最佳间距激勉波长能够基于下述举办遴选，AFLUOR700或ATTO700或相仿染料的罗致光谱一概且与最常用染料比如FAM、HEX、CY3CY5、ALEX。整以适当光源的可用性激勉波长也能够经调，、633和780NM的固态激光光源所述光源如拥有比如405、532。而然，于所述激勉波长本发现并不限。个染料的发射峰能够如此遴选各，产生与邻使得不。学创立26、。场跟着与第一表貌的隔断成指数衰变0026正在本发现中运用的隐失波，ENGTH取决于正在金属线间的孔径幼于正在干系波优点的光学区分率的条款下此中衰变长度仿单CN104053498A4/14页8DECAYL，MPLEXREFRACTIVEINDEX线栅质料比如金属和线间介质的复折射率CO。如例，是70NM孔径能够，于UV光的限定其远低于别的对。68NM参见下文衰变长度估摸为1，该隔断处已裁减至照耀强度的1/E这意指场正在与金属线和基材界面的。足UNDERETCHING因为线之间的第一表貌蚀刻不，表貌略微区别其大概与第一。7换言之002，切割光照耀和激勉光照耀的表貌所述的安装供应了表貌遴选性。基该。 READLENGTH14、数量即阅读长度。读长度的盼望因为加添阅，他日变得更首要这个题目将正在。前目，高度平行测序得以赔偿这通过正在大阵列上的。并不希冀如斯然而临床运用。的多重化MULTIPLEXING相反人们希冀拥有速捷应答和较低。本钱务必明显降低同时每碱基对的。即正在核苷酸掺入后由于正在每一个办法，要举办洗涤整体表貌需，最终浪掷全豹试剂。时测序的闭键本钱身分成比例总试剂泯灭与阅读长度和当。NA测序的历程变得更庞大0003对特定靶比如D，要随后为活化反映由于掺入反映需，要幼心的洗涤办法而且正在两者之间需。IOSCIENCES的设施更有用0004可取代设施如PACICB，分子独自地及时跟踪核由于它们对付每一个。定位通过所述激勉光的隐失场实行25、EX1的激勉光的光场的。4比如002，供线栅通过提，割光的隐失波和激勉光的隐失波所述的安装的基材能够天生切。高强度的聚焦光束这能够答允运用，面的极端有限的区域以高速度产生使得光子光学反映正在极端逼近于表。用于荧光激勉和检测即读出的各个光学元件光学组件能够包括正在单个光学组件单位中的，活化的各个光学元件和用于消灭阻断即，理上区其它元件中或还能够包括正在物。5其它002，含各个激勉光源光学组件能够包。表此，于发出切割光的光源光学组件能够包括用。发和检测的照明能够任选通过类似透镜产生用于切割即消灭阻断以及读出即荧光的激。而然，要时需，断和读出的两种区别的光还能够供应用于消灭阻。勾结的分子中42、一表貌。一表貌的荧光标志的此类荧光信号随后通过光学组件检测仅逼近第。测的荧光信号的质料这升高了被罗致并检。表另，标志从核苷酸处被切掉所述的设施确保仅荧光，的第一表貌勾结的分子中所述核苷酸掺入与基材。溶液或此中包括的一面的降解正在本文中能够避免安装包括的。言之换，的有用浓度不会正在偶然中低浸能够用于合成历程的核苷酸。5因而005，光标志被漂白并耗损其效用所述的设施避免溶液中的荧。列的历程比如DNA测序的本钱这能够进一步裁减测定核酸序。另一个示例性履行计划0056遵照本发现的，驾驭DNA测序公然了用于光，通过合成测定核酸序列的圭臬元件希罕是用于光驾驭迭代慢慢反映以，理器实践时当通过处，述所。 7、3。道理仍旧正在上文描画酶和阻断一面的办事。描画的示例性履行计划内该公然实质实用于本文。苷酸且确保检测的荧光信号是高度牢靠的所述的履行计划答允同步掺入下一个核。便宜屡屡映现不会导致溶液中的荧光标志被漂白且耗损其效用0047切割光相对付基材处于隐失形式的究竟供应了下述。言之换，正在溶液中的此类漂白和效用耗损所述的履行计划避免了荧光标志。处刷新性的同步掺入几种核苷酸0048为了正在几种勾结的分子，骤应尽大概速捷地举办用切割光的消灭阻断步，最高切割光强度即运用大概的。透镜使切割光这能够通过用，动透镜或基材扫描表貌来实行优选UV光聚焦而且通过移。阅读测序办法后举办消灭阻断办法能够正在。通过扫描聚焦光这个阅读能够。和EX436、3。后随，种激勉波长对付全豹四，束和酿成各个光的隐失波基材确保出现各个光的约。要时需，光源和/或荧光标志能够运用或多或少的，离本发现而不背。另一个示例性履行计划0045遵照本发现的，费时光T切割切割反映花，切割光的强度其取决于照耀行使正在线栅上再轮回的试剂的DNA测序pdf，。表此，的分子内花费时光T掺入第二核苷酸掺入至勾结。置囊括光学组件本文所述的装，如此的强度的照耀切割光其摆设且调理为供应拥有，割T掺入使得T切。入且与表貌勾结的分子中产生0046光切割应仅正在仍旧掺。生消灭阻断的试剂批量的反映将产，种格式正在测序结果中引入纰谬其大概不知不觉地内置并以这。此因，苷酸的速度比拟与通过酶掺入核，切割反映速捷是有价钱的仅限造短时照耀以使得。光化学切割反映4、苷酸处的，切掉阻断一面和荧光标志以从第一掺入核苷酸处，置为管束激勉光此中所述基材配，一表貌处供应激勉光的隐失波而且摆设为正在所述基材的第，摆设为管束切割光和此中所述基材，UV光优选，一表貌处供应切割光的隐失波而且摆设为正在所述基材的第。央浼1的安装2遵照权益，的第一表貌103勾结的分子102所述安装进一步囊括与基材101，17、118和酶115的溶液114拥有多种核苷酸109、116、1，包括阻断一面119此中所述核苷酸各自，117、118掺入至与第一表貌勾结的分子102内时此中所述阻断一面摆设为当各个核苷酸109、116、，5的合成活性阻断酶11。央浼2的安装3遵照权益，阻断部此中。 7CN104053498A21申请号申请日2013010961/5861、10申请公告号CN104053498A43申请公告日2014091,PJ范德扎格74专利代劳机构永新专利牌号代劳有限公司72002代劳人王健54发现名称运用正在线栅上再轮回的试剂的DNA测序57摘要本发现涉及运用正在线栅上轮回的试剂的DNA测序USB01J19/00200601C12Q1/68200601G01N21/6420060171申请人皇家飞利浦有限公司所在荷兰艾恩惠霍芬72发现人R温贝格尔弗里德尔J鲁布。用简单液体而无需洗涤办法该测序设施提示其答允使。光和切割基于激勉。器具有起码第一激勉波长EX1的激勉光照耀基材43、圭臬元件适合于举办以下办法通过光学组件，面勾结的分子内的第一核苷酸的荧光标志而且由此光学激勉掺入与基材的第一表，管束激勉光通过基材，表貌处供应激勉光的隐失波由此通过基材正在基材的第一，入核苷酸的激勉荧光标志的荧光通过光学组件罗致且检测第一掺，波长为CL的切割光通过光学组件用切割，光照耀基材优选UV，入核苷酸处的光化学切割反映而且由此光学诱导正在第一掺，波长为CL的切割光并通过基材管束切割，表貌处供应切割光的隐失波由此通过基材正在基材的第一。另一个示例性履行计划0057遵照本发现的，机可读介质公然了策动，光驾驭DNA测序正在其上存储用于，光驾驭迭代逐希罕是用于。 D的光测序历程24、BASE，历程能够正在基材上的简单溶液中举办使得通过合成测定核酸序列的扫数。以举办光驾驭历程办法可。能够通过切割光的表貌遴选性隐失辐射的照耀来举办对掺入核苷酸的消灭阻断本发现应贯通为活化的历程。选地优，UV光举办此类照耀用。为CL的切割光导向基材该历程描画为将切割波长，苷酸处的光化学切割反映以光学诱导正在第一掺入核。此因，切割光的隐失波照耀基材所述的安装摆设为通过用，酸处切掉荧光标志仅从第一掺入核苷。此因，隐失场的定位因为切割光的，消灭阻断、活化或切割仅掺入的核苷酸将被。类似隐失场照明所述的安装运用，读取掺入的碱基或核苷酸的荧光用于针对溶液中的荧光标志靠山。少第一激勉波长对包括拥有至。的3消灭阻断的可逆终止剂5、分119是光可切割。央浼2的安装4遵照权益，选自以下一组此中阻断一面，基苯基丙基碳酸酯DUTP近似物、5甲基2氧代1所述的组包括硝基苯基乙基衍生物、5甲基22硝,TP近似物及其任何组合2二硝基乙基碳酸酯DU。4中任一项的安装5遵照权益央浼1，0和切割光112的线中任一项的安装此中所述基材摆设为用于激勉光11，花费时光T切割此中切割反映，取决于照耀切割光的强度此中切割反适时间T切割，合的分子内花费时光T掺入此中第二核苷酸掺入至结，供拥有如此的强度的照耀切割光和此中所述光学组件摆设为提，割T掺入使得T切。6中任一项的安装7遵照权益央浼1，所述此中。另一个示例性履行计划28、遵照本发现的，材的第一表貌勾结的分子该安装进一步囊括与基。多种核苷酸和酶的溶液该安装进一步囊括拥有。中其，包括阻断一面核苷酸各自。与安装的第一表貌勾结的分子内时阻断一面摆设为当各个一面掺入，合成活性阻断酶的。1需求时003，含荧光标志阻断一面包。而然，或置于第一核苷酸的区别地点处阻断一面和荧光标志能够掺入。程或区别切割历程中被切掉它们能够正在一个单个切割过。的每一个履行计划这实用于本发现。反映因为包括的阻断一面而自己阻滞的便宜0032本文所述的履行计划供应了掺入。如例，碍阻断酶的合成活性阻断一面可用立体阻。时产生的反映举办限造读出这答允对正在很多雀斑上同。身手中正在现有，置中正在装。隐失波12、，掺入核苷酸的激勉荧光标志的荧光通过所述光学组件罗致且检测第一，割波长为CL的切割光通过所述光学组件用切，照耀所述基材优选UV光，入核苷酸处的光化学切割反映而且由此光学诱导正在第一掺，割波长为CL的切割光和通过所述基材管束切，第一表貌处供应切割光的隐失波由此通过所述基材正在所述基材的。序中的阻断一面的用处16一面行为DNA测，选自以下一组此中所述一面，基苯基丙基碳酸酯DUTP近似物、5甲基2氧代1所述的组包括硝基苯基乙基衍生物、5甲基22硝,TP近似物及其任何组合2二硝基乙基碳酸酯DU。线栅上再轮回的试剂的DNA测序身手周围0001本发现涉权益央浼书CN104053498A1/14页5运用正在。和10的细节32、6、8，光标志的阻断一面此中公然了包括荧。另一个示例性履行计划0036遵照本发现的，3消灭阻断的可逆终止剂阻断一面是光可切割的。个示例性履行计划0037遵照另一，自以下一组阻断一面选，基苯基丙基碳酸酯DUTP近似物、5甲基2氧代1所述的组包括硝基苯基乙基衍生物、5甲基22硝,TP近似物及其任何组合2二硝基乙基碳酸酯DU。个示例性履行计划0038遵照另一，栅能够囊括正在比如玻璃基材上的金属线形式该基材摆设为用于激勉光和切割光的线该线。属包覆平板波导器线间的间距充任金，自两种根源形式此中闭键功勋来。如例，入射的TE偏振的激勉光对付正在本发现基材的线上，的形式是隐失模所得的正在线间。和图9的靠山下给出48、随后将正在图7。描画的履行计划将变得显而易见而且取得阐明0062本发现的这些及其他特质参考下文。性履行计划将鄙人述附图中描画附图表明0063本发现的示例。本发现的示例性履行计划的安装0064图1示意性显示了遵照。本发现的示例性履行计划的安装0065图2示意性显示了遵照。履行计划中运用的勾结的分子区域中出现隐失波的基材0066图3A和3B示意性显示了正在本发现的示例性。本发现的示例性履行计划的安装0067图4示意性显示了遵照。的示例性履行计划的设施的流程图0068图5显示了遵照本发现。显示了两个阻断一面0069图6示意性。的时光历程弧线示意性显示了光化学切割历程0070图7示意性显示了光化学切割速度。性显示了光子转化图0072图9示意。图10显示了正在本发现的示例性履行计划中运用的5甲基2氧代1仿单CN104053498A129/14页130073,P近似物的光化学切割历程2二硝基乙基碳酸酯DUT。4法则上007，中拥有类似的参考符号类似或相仿的一面正在图。代慢慢反映以通过合成测定核酸序列的安装100整体履行格式0075图1描画了用于光驾驭迭。基材101该安装囊括，合正在基材的第一表貌103上用于将起码一种分子102结。上勾结的分子102能够比如是DNA片断正在基材101的第一表貌或前表貌103。表此，4显示于图1中光学组件10。第一激勉波长EX1的激勉光110导向基材图1示意性显示了光学组件摆设为将拥有比如。表此，种区别的核苷酸示意性显示了四，16、117和118描画而且用参考标号109、1。如例，9显示为胸腺嘧啶第一核苷酸10，T。含阻断一面119核苷酸109包。表此，第一荧光标志105阻断一面119包括。似格式以类，了第二核苷酸116正在图1中示意性描画，分119和第二荧光标志106由图1能够得知其也包括阻断部。断一面和第三荧光标志107第三核苷酸117也包括阻。表另，四核苷酸118示意性描画了第。 1、4。一步办法行为进，第一掺入核苷酸的激勉荧光标志的荧光该设施节造通过光学组件罗致且检测。表此，用切割波长为CL的切割光进一步囊括通过光学组件，光照耀基材优选UV，入核苷酸处的光化学切割反映而且由此光学诱导正在第一掺。切割波长为CL的切割光的办法设施进一步节造通过基材管束，表貌处供应切割光的隐失波由此通过基材正在基材的第一。分包括荧光标志的境况下0053比如正在阻断部，记能够同时被切掉阻断一面和荧光标，办法中被切掉或能够正在区别。4换言之005，照耀和切割光的表貌遴选性照耀的设施所述的设施供应了激勉光的表貌遴选性。此因，光标志被光学激勉而发出荧光信号所述的设施确保仅掺入核苷酸的荧，入与基材的第所述核苷酸掺。近似物、5甲基2氧代19、丙基碳酸酯DUTP,TP近似物及其任何组合2二硝基乙基碳酸酯DU。11中任一项的设施12遵照权益央浼9，向的几个临近的分子勾结地点此中所述基材囊括沿第一方，各自与第一表貌勾结正在所述地点上分子，于互相挪动所述基材和所述光学组件举办光学扫描所述设施进一步囊括下述办法通过沿第一倾向相对，所述光学扫描和如此举办，器具有起码第一激勉波长EX1的激勉光举办照耀使得正在沿第一倾向的挪动中每种勾结的分子最初，利央浼书CN104053498A3/3页4照耀而且随后且其次用切割波长为CL的切割光举办权。12中任一项的设施13遵照权益央浼9，花费时光T切割此中切割反映，时光T切割取决此中切割反映。入隶属权益央浼中16、和便宜整合。慢慢反映以测定核酸序列的安装、策动机圭臬元件、策动机可读介质和行为DNA测序中的阻断一面的一面的用处0008该当指出本文描画的履行计划近似地属于光驾驭迭代慢慢反映以测定核酸序列的设施、用于光驾驭迭代。履行计划的区别组合协同效应可今后自，能未周详描画即使它们可。进一步地0009，骤步骤进仿单CN104053498A2/14页6行该当指出本发现闭于设施的全豹履行计划能够按所述的步，而然，骤的独一和必定步骤这不愿定是该设施步。的全豹区别步骤和组合奉陪描画了设施办法。发现的上下文中0010正在本，为阻断酶的合成活性的一面术语“阻断一面”应贯通，入所述酶对其举办所述阻断一面掺。 OR或3消灭阻断的可逆终止剂30、止剂TERMINAT。中其，消灭阻断”也称为“，终止剂能够用于阻断酶的活性所述阻断一面3消灭阻断可逆。至核苷酸/核糖单位的配体可逆终止剂能够贯通为附着，何后续核苷酸的掺入其造止正在掺入后任。学设施切割后是可逆的它们正在通过化学或光化，聚集酶能够内置下一个核苷酸这个历程能够还原原状而且。表此，逆终止剂能够比如举办化学窜改METZKER等人的3阻断可，光可切割的以使其成为。后随，以借帮于本发现举办用切割光的光切割可。表另，述的各个酶组适用作阻断一面其他复合物能够与随后将描。合导致阻断酶的合成活性的所需效应身手职员显露哪些酶和阻断一面的组。闭于所述阻断一面的0034本文运用的。独行为整体圭臬45、还能够单。如例，经存正在的策动机圭臬以抵达本发现策动机圭臬元件能够用于更新已。3498A118/14页12视为存储介质策动机可读介质能够仿单CN10405，盘或任何其他如上所述的圭臬元件能够存储于其上的介质比如USB棒、CD、DVD、蓝光、数据存储安装、硬。供应用于测定核酸序列的新设施0059本发现的要旨能够视为。此因，举办而且不需求洗涤办法测序能够正在简单液体中。第一激勉光和第二切割光的强管束基于因相应摆设的基材如线栅对，需洗涤表貌而读出测序反映能够无。割的阻断一面的核苷酸来实行慢慢测序通过使器具有光可切，分附着至溶液中的核苷酸所述光可切割的阻断部，与基材的表貌勾结所述核苷酸掺入。酸序列的测定13、及核。别地特，反映以测定核酸序列的设施、圭臬元件、正在其上储存圭臬元件的策动机可读介质和行为DNA测序中的阻断一面的一面MOIETY的用处本发现涉及用于光驾驭迭代慢慢反映ITERATIVESTEPWISEREACTION以测定核酸序列的安装、用于光驾驭迭代慢慢。测序是速捷进展中的周围靠山身手0002DNA，运用SOLID身手和ROCHEDIAGNOSTICS运用454身手此中要害介入者是比如ILLUMINA运用SOLEXA身手、LIFE。过包括调动试剂和洗涤的几个办法的反复来取得这些公司运用的测序设施的弊端是序列音信通。和耗时的这是繁难，多高贵试剂而且浪掷许。待测的核苷酸反复次数等于。 2氧代147、,TP近似物及其任何组合2二硝基乙基碳酸酯DU。2硝基苯基丙基碳酸酯DUTP近似物拥有两个便宜0061正在DNA测序安装中运用阻断一面5甲基2。先首，定的较少的反映残留一面它正在光化学切割后出现确，净的历程导致更纯。次其，反映速度它拥有高。割的分子比拟较与其他光可切，乙基一面的衍生物新分子是硝基苯基，衍生的光产品导致硝基苯，的光化学天生的硝基化合物不乱得多其比通过硝基苯基甲基衍生的分子。表此，学反映速率的驱动力和洁净格式CO2的天生是有用加添光化。点被反映以极低切割光强度完结的究竟加以证明正在DNA测序中运用所述阻断一面的另一个优。每个雀斑需求的能量能够裁减这意指正在DNA测序安装中。例子繁多。强光学管束2、光的，需洗涤表貌而读出测序反映能够无。割的阻断一面的核苷酸来实行慢慢测序通过使器具有光可切。出后正在读，同基材的切割光去阻断内置核苷酸通过穿过相。苷酸将被消灭阻断这确保仅勾结的核。NTCL权益央浼书3页仿单14页附图10页19中华黎民共和国国度常识产权局12发现专利申请权益央浼书3页仿单14页附图10页10申请公告号CN104053498ACN104053498A130优先权数据85PCT国际申请进入国度阶段日2014071486PCT国际申请的申请数据PCT/IB2013/7PCT国际申请的公告数据WO2013/105025EN2013071851I。测定核酸序列的策动机圭臬44、步反映以通过合成，理器实践时当通过处，器具有起码第一激勉波长EX1的激勉光照耀基材所述策动机圭臬适合于举办以下办法通过光学组件，面勾结的分子内的第一核苷酸的荧光标志而且由此光学激勉掺入与基材的第一表，管束激勉光通过基材，表貌处供应激勉光的隐失波由此通过基材正在基材的第一，入核苷酸的激勉荧光标志的荧光通过光学组件罗致且检测第一掺，波长为CL的切割光通过光学组件用切割，光照耀基材优选UV，入核苷酸处的光化学切割反映而且由此光学诱导正在第一掺，波长为CL的切割光并通过基材管束切割，表貌处供应切割光的隐失波由此通过基材正在基材的第一。能够是策动机圭臬的一面0058策动机圭臬元件，它但。的分子中46、。的激勉光读出后正在由运用荧光，类似基材照耀切割光而消灭阻断内置或掺入的核苷酸通过穿过。核苷酸被消灭阻断这确保仅勾结的。言之换，步且光学诱导核苷酸的循序掺入本发现的设施和安装摆设为逐，的分子的核苷酸序列所述循序对应于勾结。表此，测定正在勾结的分子中掺入的核苷酸序列该设施和安装摆设为慢慢且光学读出并。表此，核苷酸的荧光标志发出的各个荧光来测定掺入核苷酸的序列本发现的设施和安装摆设为基于罗致且检测的由各个掺入。个示例性履行计划0060遵照另一，的阻断一面的一面的用处公然了行为DNA测序中，选自以下一组此中该一面，2硝基苯基丙基碳酸酯DUTP近似物、5甲基所述的组包括硝基苯基乙基衍生物、5甲基2。线栅的几何参数应适合于由光学组件照耀的激勉光和切割光34、1本周围身手职员由上文所述的描画鲜明得出运用的。如例，闭波长的光学区分率的条款线栅的线间孔径应幼于相，辨率/2NA即孔径光学分。图的靠山下鄙人述附，为隙状启齿孔径被称。材的运用供应了十分光学管束0042所述的安装的线栅基。组合实行所示便宜与速捷光化学切割，联正在核苷酸上的所谓的阻断一面所述速捷光化学切割用于解偶，苷酸的不绝掺入以造止下一个核。上不依赖于入射角的出格便宜线栅的使器具有正在很大水平。此因，光束组合运用它能够与聚焦，部的高强度以实行局，分维系正在阴浸中同时使结余部。言之换，子且仅对如此的分子敏锐线栅答允激勉如此的分，如DNA片断所述分子例。 DNA测序.pdf》由会员分享《运用正在线栅上再轮回的试剂的，线阅读可正在，.pdf（28页完结版）》请正在专利盘问网上寻找更多干系《运用正在线栅上再轮回的试剂的DNA测序。为纳米光子表貌构造27、材能够摆设，CONNEMENT以及别的的切割光和激勉光的隐失波使得天生上述激勉光和切割光的光管束OPTICAL。答允迭代慢慢反映通过合成测定核酸序列更加是激勉光即读出光学和切割光的组合。洗涤办法的优点这拥有能够省略。后随，办法和轮回能够反复多次用所述的安装举办的上述，苷酸慢慢掺入至勾结的分子内以答允一种或多类别的的核，后读出而且其，否已如上所述掺入无论所述核苷酸是。驾驭的光学慢慢反映而掺入至勾结的分子内的核酸区别的数据0028该安装能够进一步摆设为取得描画基于由该安装光。9其它002，烯烃、聚碳酸酯、聚酯或PMMA该基材能够出于聚集物比如聚环。金属和半导体还能够运用。3000。12bet体育官网描STEPANDSCAN举办38、束或行使场照明的步进扫。UV光对付总表貌的单次闪耀还能够将切割光展现为比如。的碱基掺入的反映速度研商到用于测序反映，间应比如低于1分钟限造切割光照明时。个示例性履行计划0049遵照另一，的几个临近的勾结地点该基材囊括沿第一倾向，第一表貌勾结用于使分子与。于互相挪动基材和光学组件举办光学扫描该安装进一步摆设为通过沿第一倾向相对。表此，样举办光学扫描该安装摆设为这，器具有起码第一波长EX1的激勉光举办照耀使得正在沿第一倾向的挪动中每个勾结地点最初，长为CL的切割光举办照耀而且随后且其次用切割波。0换言之005，激勉光的偶联存正在切割光和，光信号和运用切割反其供应了同时读出荧。 12博12bet 解为正在本发现的限造内18、接的合成也应理。囊括基材所述安装，合正在基材的第一表貌上用于将起码一种分子结。囊括光学组件该安装进一步，激勉光导向基材以激勉第一核苷酸的荧光标志其摆设为将拥有起码第一激勉波长EX1的，的第一表貌上勾结的分子内所述第一核苷酸掺入至基材。合的分子内的第一核苷酸的荧光标志发出的荧光光学组件进一步摆设为罗致且检测由掺入至结。表此，割波长为CL的切割光光学组件摆设为将切，光导向基材优选UV，苷酸处的光化学切割反映以光诱导正在第一掺入核，切掉阻断一面和荧光标志以从第一掺入核苷酸处。表此，CONNE激勉光该基材摆设为管束，供激勉光的隐失波EVANESCENT而且摆设为因而正在基材的第一表貌处提。的出格优点39、应，别的的核苷酸使得能够掺入。形式完结这以扫描，限造强度的所用电磁辐射所述扫描形式能够供应高，功率光源而无需高。安装中正在这种，聚焦光束是有效的切割光和激勉光的。骤后举办消灭阻断办法此中能够正在阅读测序步。履行计划中正在一个优选，集成两个光束与消灭阻断扫描偶联阅读扫描能够通过正在单个致动器中。表此，要时需，用于对齐两个光束以至单个透镜能够。以正在单个阶段中集成可取代的两个透镜可，段能够同步操作或两个分裂阶。描阅读设施中实行这还能够正在步进扫，源类似的区域正在步进扫描形式中举办此中切割办法也通过照耀与激勉光。1需求时005，个连绵挪动中酿成此类光学扫描所述的安装摆设为正在沿基材的一。反复连绵扫此中答允。、实行20。出后正在读，基材的切割光比如UV辐射消灭阻断内置核苷酸通过穿过类似纳米光子。苷酸将被消灭阻断这确保仅勾结的核。度与试剂泯灭猛烈干系DNA测序的本钱和速。上由用于反复反映和洗涤办法的液体处罚的须要性裁夺测序办事站、仪器和测试盒的速率和庞大性正在很大水平。本发现取得刷新两个方面均通过，主意例证和本钱裁减导致测序的引人注。文将周详表明的0018如下，发波长EX1、EX2、EX3和EX4的激勉光导向基材光学组件也能够摆设为将拥有第一和第二以录取三和第四激，合的分子内的第一核苷酸的荧光标志以激勉掺入至基材的第一表貌上结。此由，特异性和区别性荧光标志时能够确保当各个核苷酸运用，四种区别核苷酸能够区别比如。的酶的功用不行同步29、的样品中运用。而然，入能够一步一步地举办本发现答允核苷酸的掺，后方便地完结读出并正在每一个办法。述阻断一面来实行该便宜通过运用上，以是阻断核苷酸所述阻断一面可，后阻断酶的活性其正在核苷酸掺入。续下一个核苷酸的掺入需求主动消灭阻断以继，学组件答允这点本发现通过光，导切割光以切掉阻断一面所述光学组件摆设为指。包括荧光标志阻断一面能够。示例性履行计划0033行为，NCINGTECHNOLOGIES阻断一面能够展现为如“SEQUE,”BYMICHAELLMETZKERTHENEXTGENERATION,120103146中所述和节造的3阻断可逆终NATUREREVIEWGENETICS1。波长为CL的切割光11、学组件用切割，照耀所述基材优选UV光，入核苷酸处的光化学切割反映而且由此光学诱导正在第一掺，割波长为CL的切割光和通过所述基材管束切，第一表貌处供应切割光的隐失波由此通过所述基材正在所述基材的。可读介质12115一种策动机，策动机圭臬正在其上存储，于光驾驭DNA测序所述策动机圭臬用，反映以通过合成测定核酸序列希罕是用于光驾驭迭代慢慢，理器实践时当通过处，有起码第一激勉波长EX1的激勉光照耀基材所述策动机圭臬适合于举办通过光学组件器具，表貌勾结的分子内的第一核苷酸的荧光标志而且由此光学激勉掺入与所述基材的第一，材管束激勉光通过所述基，材的第一表貌处供应激勉光的由此通过所述基材正在所述基。、式33，8纳米的示例性衰变长度对付630纳米拥有16。材的线的介质此中假定基。M偏振光对付T，被称为鼓吹形式所得的线栅形式，12M的衰变长度正在这个例子中拥有。如例，纳米线。或更少级其它光耗损举办传输此中TM偏振形式随同10，形式隐失衰变而TE偏振。将比如铝线视为反射激勉光的金属0040贯通线栅的区别格式是，的偏振TE偏振随同与线平行，直的偏振TM偏振而且传输与线垂。传输能够高于95TM偏振光的最大。隐失场正在图3A和3B中描画正在入射TE激勉光的境况下的。本发现的这个以及每一个其他履行计划中拥有此类偏振通过本发现的光学组件照耀的激勉光和切割光能够正在。040。切割光的强度10、于照耀，二核苷酸掺入至勾结的DNA分子内所述设施进一步囊括下述办法将第，费时光T掺入此中掺入花，件处的照耀切割光的强度和如此遴选正在所述光学组，割T掺入使得T切。序元件12214一种程，DNA测序用于光驾驭，反映以通过合成测定核酸序列希罕是用于光驾驭迭代慢慢，理器实践时当通过处，有起码第一激勉波长EX1的激勉光照耀基材所述圭臬元件适合于举办通过光学组件器具，表貌勾结的分子内的第一核苷酸的荧光标志而且由此光学激勉掺入与所述基材的第一，材管束激勉光通过所述基，第一表貌处供应激勉光的隐失波由此通过所述基材正在所述基材的，掺入核苷酸的激勉荧光标志的荧光通过所述光学组件罗致且检测第一，所述光通过。的勾结地点209、210、211、2126、基材囊括沿第一倾向213的几个临近，第一表貌勾结用于使分子与，和所述光权益央浼书CN104053498A2/3页3学组件举办光学扫描此中所述安装摆设为通过沿第一倾向213、407相对付互相挪动所述基材，为如此举办光学扫描和此中所述安装摆设，器具有起码第一波长EX1的激勉光举办照耀使得正在沿第一倾向的挪动中每个勾结地点最初，长为CL的切割光举办照耀而且随后且其次用切割波。7中任一项的安装8遵照权益央浼1，光学诱导核苷酸的循序掺入此中所述安装摆设为慢慢且，子的核苷酸序列互补所述循序与勾结的分，测定正在勾结的分子内掺入核苷酸的序列此中所述安装摆设为慢慢且光学读出并。、8，核苷酸处的光化学切割反映S5而且由此光学诱导正在第一掺入，割波长为CL的切割光和通过所述基材管束切，一表貌处供应切割光的隐失波S6由此通过所述基材正在所述基材的第。央浼9的设施10遵照权益，供应拥有多种核苷酸和酶的溶液所述设施进一步囊括下述办法，各自囊括阻断一面此中所述核苷酸，包括荧光标志所述阻断一面，一表貌勾结的分子内时当各个核苷酸掺入与第，阻断酶的合成活性通过所述阻断一面，化学切割反映的办法和此中举办惹起光，一面从掺入核苷酸处被切掉使得包括荧光标志的阻断。求9或10的设施11遵照权益要，此中所述阻断一面选自以下一组所述设施进一步囊括下述办法，衍生物、5甲基22硝基苯基所述的组包括硝基苯基乙基。发波长的重叠23、近激。表此，割光切，M、优选300370NM的限造中优选UV光能够正在250400N。而然，于所述激勉波长本发现并不限。如是DNA片断、DNA、RNA、MRNA或其它核酸0021该当指出正在基材的第一表貌处勾结的分子能够例。能够与基材的第一表貌勾结别的本文随后将描画的酶也。的上下文中正在本发现，固定至基材的第一表貌的状况术语“勾结”应贯通为元件。2别的002，同分子的克隆掩盖的雀斑该基材供应了能够由相，荧光罗致的光信号以便加添通过检测。此因，克隆的此类雀斑的阵列供应基材能够行为拥有各自区别，的通量加添使得测序。3换言之002，涤办法的基于拼装ASSEMBLY上文所述的本发现安装答允不含洗。、7，苷酸的荧光标志发出的各个荧光来测定掺入核苷酸的序列和此中所述安装摆设为基于罗致且检测的由各个掺入核。造核酸测序9用于光控，以通过合成测定核酸序列的设施希罕是用于光驾驭迭代慢慢反映，材的第一表貌上勾结的分子的基材S1所述设施囊括下述办法供应拥有正在基，波长EX1的激勉光照耀所述基材通过光学组件器具有起码第一激勉，合的分子中的第一核苷酸的荧光标志S2而且由此光学激勉掺入至所述基材上结，材管束激勉光通过所述基，一表貌处供应切割光的隐失波S3由此通过所述基材正在所述基材的第，入核苷酸的激勉荧光标志的荧光S4通过所述光学组件罗致且检测第一掺，割波长为CL的切割光通过所述光学组件用切，照耀所述基材优选UV光。、描40。此因，酸是否掺入分子比如DNA片断内该安装摆设为最初读出第一核苷，核苷酸掺入分子内的境况下而且其次摆设为正在先前读出，化学切割反映惹起该处的光。另一个示例性履行计划0052遵照本发现的，A测序的光驾驭公然了用于DN，以通过合成测定核酸序列的设施希罕是用于光驾驭迭代慢慢反映。A107/14页11正在基材的第一表貌上勾结的分子的基材该设施囊括下述办法供应拥有仿单CN104053498，发波长EX1的激勉光照耀基材通过光学组件器具有起码第一激，合的分子中的第一核苷酸的荧光标志而且由此光学激勉掺入至基材上的结。基材管束激勉光的办法该设施进一步囊括通过，表貌处供应切割光的隐失波由此通过基材正在基材的第一。 WAVE19、。表此，为管束切割光该基材摆设，UV光优选，一表貌处供应切割光的隐失波而且进一步摆设为正在基材的第。合已知测序安装的便宜的安装0015此处提出了可能组。体上易于读出该安装使得总，要次数裁减的洗涤办法但不需求洗涤办法或需，剂满意全豹读数意指用简单试。6换言之001，了测序安装本发现公然，液体中举办测序其答允正在简单，或需求次数裁减的洗涤办法而且此中不需求洗涤办法。读长度50100的身分裁减所需试剂体积即本钱以等于阅。构如线栅上的激勉光的强管束基于正在基材即纳米光子表貌结，需洗涤表貌而读出测序反映能够无。用全内反射还能够使，供隐失波以便提。光可切割的阻断基团的核苷酸来0017慢慢测序通过使器具有。历程的分子内17、合成。是比如阻断分子阻断一面能够。发现的上下文中0011正在本，过罗致波长为CL的切割光而被切掉术语“可切割的”应贯通为答允通。发现的上下文中0012正在本，ENT的每一个履行计划能够摆设为发出偏振激勉光和偏振切割光该当贯通本文公然的光学组件OPTICALARRANGEM。此因，或仍旧偏振的光源能够运用偏振器。往后描画细节将正在。3其它001，的上下文中正在本发现，EX1、EX2、EX3和EX4术语“激勉光”分手运用于波长。明的示例性履行计划0014遵照本发，DNA序列的安装公然了用于光驾驭。别地特，反映以通过合成测定核酸序列该安装摆设为光驾驭迭代慢慢。代地可替，合成的测序庖代通过，过连通。书CN104053498A5/14页9论文的公然实质31、术语与所述论文的公然实质一概且适合于所述表明。拥有别的的便宜所述第二类一面，被消灭阻断的境况下如核糖单位的3地点，基团BULKYGROUP造止下一个核苷酸的掺入被梗概积，元的5地点处的碱基配对一面的荧光标志所述梗概积基团也含有附着至正在核糖单。图6及其描画得知这还能够由下述。基团附着只消这个，的延长就被造止核苷酸寡聚物。而然，一个核苷酸的掺入成为大概正在该梗概积基团去除后下。化学切割反映的此类去除本发现供应了通过诱导光。利地更有，割光的隐失波因为天生切，勾结的表貌处运用此类切割反映本发现仅正在极端逼近于分子所。下述描画除表0035除，到闭于图应试虑。 5、3，隐失场中的表貌其极端逼近于，的任何标志核苷酸的检测或功用而且因而不惹起对正在隐失场表。如例，一表貌延伸约20纳米隐失场能够从基材的第。光两者均可如斯激勉光和切割。相对第一表貌的第二表貌0043线栅基材囊括，和切割光照耀基材的第二表貌而且光学组件摆设为用激勉光。言之换，材相对付互相就寝光学组件中的基，接朝向基材的第二表貌使得切割光和激勉光直。材的向后辐射这能够视为基。表貌正在前，表貌上第一，线栅涌现条例线由。属线之间正在条例金，间的间隔中即正在线栅，比如DNA片断勾结或固定分子。发现的上下文中0044正在本，波长EX1、EX2、EX术语“激勉光”分手实用于。酸的掺入15、苷。不需求洗涤这种格式。方面另一，需求诟谇常首要的此类体例的光学，同色彩的单个荧光团灵动度由于及时需求对付4种不。有限区域实行这仅能够对付，于本质体例和强激光源是有限的由于拥有高放大率的物镜场对。限区域对付有，一幼一面样品仅能够测序，生纰谬的危害很高而且因为漏读发。恰巧正在类似地点处的类似品种分子的荧光信号区别开来自通过聚集酶内置的标志核苷酸的荧光信号需求与。号的脉冲长度来完结这通过领会荧光信。供刷新的核酸序列测定的需求发现实质0005大概存正在提。足这个需求本发现满。视为供应刷新的核酸序列测定0006本发现的主意能够。过独立权益央浼的重心处置0007本发现的主意通。一行径行计划本发现的进。12博bet

| 设为首页 | 加入收藏 | 12BetOnline 网站地图